在医疗水平和综合实力方面，一般来说三级甲等医院比二级甲等医院更好。因为三级甲等医院比二级甲等医院医疗资源更丰富、科室设置更全面、医生水平更高、科研教学实力更强、医疗质量管控更严格等。具体如下：

1、医疗资源更丰富：三级甲等医院通常规模更大，床位数量一般在500张以上，而二级甲等医院床位多在101张至500张之间。三级甲等医院拥有更多先进的医疗设备，如高精度的核磁共振、CT扫描仪、达芬奇手术机器人等，能够为复杂疾病的诊断和治疗提供更有力的支持。例如，对于一些罕见病的诊断，可能只有三级甲等医院具备相应的高端设备。

2、科室设置更全面：三级甲等医院科室划分极为细致，涵盖众多专科和亚专科，能处理各种疑难杂症。相比之下，二级甲等医院科室相对较少，对于一些特殊疾病的诊治能力有限。比如，三级甲等医院可能有专门的器官移植中心、血液病研究所等，能够为患者提供更专业的医疗服务。

3、医生水平更高：三级甲等医院的医生学历普遍较高，很多是博士、硕士，高级职称医生比例大。有更多机会参加国内外学术交流和培训，临床经验更丰富。而二级甲等医院医生相对来说学历和职称稍低一些。例如，在复杂手术和疑难病症的诊断上，三级甲等医院的医生往往更有经验和能力。

4、科研教学实力更强：三级甲等医院承担着大量的科研任务和教学工作，是医学科研和人才培养的重要基地。有较强的科研实力，能够推动医学进步。二级甲等医院科研和教学任务较少，主要侧重于临床诊疗。

5、医疗质量管控更严格：三级甲等医院有更完善的医疗质量控制体系，对医疗服务的各个环节严格管理，确保安全有效。在医疗流程、病历书写、药品管理等方面都有更高的标准和规范。

总之，如果遇到普通疾病，二级甲等医院通常可以满足治疗需求，而且就诊等待时间可能较短。但如果是疑难重症、需要复杂手术或高水平的专科诊疗，应优先选择三级甲等医院。同时，要注重日常的健康管理，保持良好的生活习惯，预防疾病的发生。定期体检，早发现早治疗，减少对高等级医院的依赖。